香港故宫文化博物馆共设有九个展览厅,举办专题展览(展期为一年或以上)及特别展览(展期为三至六个月)。五个专题展厅旨在介绍故宫历史文化,展示精选的故宫博物院书画、器物和古籍等藏品,从多角度讲述宫廷建筑、重要人物、史事以及皇家收藏的精彩故事。另有两个专题展厅会展示香港艺术收藏,并为家庭、学生和儿童提供互动体验活动。两个特别展厅用于举办本馆独立策划或与其他机构合作策划的大型展览,主题有中国与世界在历史、艺术和文化方面的交流等。